graph mining

Sviluppo di un nuovo algoritmo di deep graph learning per la predizione di interazioni tra farmaci e proteine target. Inoltre, l’articolo include un' applicazione del metodo per il riposizionamento di farmaci al fine di trattare l’infezione da Covid-19.

Sviluppo di una nuova metodologia di machine learning per far luce sulla similarità delle malattie. Per l’analisi, la metodologia integra una strategia di clustering gerarchico con le relazioni di prossimità tassonomica in ontologie di malattie definite manualmente da curatori, e di prossimità strutturale dei relativi moduli di malattie nella rete dell’interattoma umano.

Siamo stati invitati a scrivere un capitolo del libro “Deep Learning in Biology and Medicine”. Nel capitolo, introduciamo i concetti fondamentali delle reti biologiche e offriamo una rassegna dello stato dell’arte delle strategie di deep learning sviluppate per le sfide maggiori in Network Biology, Network Medicine e Network Pharmacology.

Sviluppo di una nuova metodologia di machine learning per far luce sulla similarità delle malattie. La metodologia sfrutta una , che attraverso l’analisi delle relazioni di prossimità tassonomica in ontologie di malattie definite manualmente da curatori, e prossimità strutturale dei relativi moduli di malattie nella rete dell’interattoma umano.

Sviluppo di una nuova metodologia per la l’induzione automatica di una struttura gerarchica dei moduli di malattie, a partire da relazioni di prossimità ricavate dalla rete dell’interattoma. Inoltre, sono stati sviluppati ulteriori algoritmi per l’allineamento e l’etichettatura e il confronto sistematico di questa struttura rispetto ad ontologie di malatti definite manualmente da curatori.

Un nuovo metodo di graph deep learning per la predizione di associazioni gene-malattia. Il metodo estrae pattern funzionali e di connettività in maniera congiunta, usando un innovativa tecnica basata su attributed random walks.

Un nuovo metodo di graph deep learning per la predizione di associazioni gene-malattia. Il metodo estrae pattern funzionali e di connettività in maniera congiunta, usando un innovativa tecnica basata su attributed random walks.

Un nuovo metodo di graph deep learning per la predizione di associazioni gene-malattia. Il metodo estrae pattern funzionali e di connettività in maniera congiunta, usando un innovativa tecnica basata su attributed random walks.

Un nuovo metodo di graph deep learning per la predizione di associazioni gene-malattia. Il metodo estrae pattern funzionali e di connettività in maniera congiunta, usando un innovativa tecnica basata su attributed random walks.

Presenzatione dei porgetti in sviluppo presso il gruppo di ricerca IIM. Come progetto di ricerca per il workshop “AI for Health and Medicine”, ho presentato la prima versione di RW², un nuovo modello di graph deep learning per la predizione di associazioni gene-malattia.